سمینار برق پیشگویی ساختار پروتیین ها به کمک کنترل فازی

سمینار برق پیشگویی ساختار پروتیین ها به کمک کنترل فازی

لطفا از این پروژه در راستای تکمیل تحقیقات خود و در صورت کپی برداری با ذکر منبع استفاده نمایید.

چكیده 

در این تحقیق به بررسی كنترل فازی در تعیین ساختار پروتئین ها می پردازیم. ابتدا ساختار چهار گانه پروتئین ها معرفی شده است ساختار اول توالی اسیدهای آمینه به عنوان اجزای سازنده پروتئین در یك زنجیره پلی پپتیدی معرض می شود. ساختار دوم پروتئین ها را ساختار موضعی یا نظم در یك بعد نیز می گویند ساختار سوم پروتئین همان شكل كروی و به هم فشرده آن است و ساختار چهارم به بررسی جایگری و شكل زیر واحدهای ساختاری پروتئین می پردازد. 

در ادامه كنترل كننده های فازی به عنوان روشی برای توصیف پدیده های نامشخص و همراه عدم قطعیت معرفی شده است از آنجا كه دنیای بیوانفورماتیك بسیار پیچیده تر از آن است كه بتوان آن را بطور دقیق توصیف و مدل كرد و عملكرد آن را بدست آورد. بنابراین با یك مدل تقریبی یا همان فازی كه قابل قبول و قابل تجزیه و تحلیل باشد به پیشگویی ساختار پروتئین ناشناخته و جدید می پردازیم و به دنبال این هستیم كه بالاترین شباهت را بین پروتئین ناشناخته و یك پروتئین كه از قبل آن را می شناختیم بدست آوریم.

فهرست مطالب: 

چكیده.......................................................................................................................................................................... 1

مقدمه........................................................................................................................................................................... 2

فصل اول : كلیات................................................................................................................................................... 3

1 هدف............................................................................................................................................................ 4 -1

2 پیشینه تحقیق.......................................................................................................................................... 5 -1

3روش كار و تحقیق..................................................................................................................................... 5 -1

فصل دوم : ساختار پروتئین ها ........................................................................................................................ 7

1-2 مقدمه ....................................................................................................................................................... 8

2-2 نیروهای غیر كووالان در ساختار پروتئین .............................................................................. 11

1-2-2 بر همكنش های الكتروستاتیك............................................................................................. 12

2-2-2 بر همكنش واندروالز................................................................................................................... 12

3-2-2 پیوندهای هیدورژنی................................................................................................................... 13

4-2-2 بر همكنش های آب گریز........................................................................................................ 14

5 نقش آب در سلول..................................................................................................................... 14 - 2-2

6-2-2 اسیدهای آمینه گوناگون............................................................................................................ 16

ح

3-2 ساختار پروتیئنی............................................................................................................................... 17

1-3-2 ساختار اول..................................................................................................................................... 17

1-1-3-2 آرایش فضایی در زنجیره پلی پپتین.............................................................................. 19

2ساختار دوم.................................................................................................................................... 21 -3-2

1-2-3-2 مارپیچ ها .................................................................................................................................. 21

2-2-3-2 صفحات تا خوردة بتا............................................................................................................ 22

3-3-2 ساختار اولیه فرا ثانویه............................................................................................................. 25

4-3-1 ساختار سوم ............................................................................................................................... 25

5-3-2 ساختار چهارم............................................................................................................................ 27

4-2 پروتئین های مرتبط به هم از نظر تكاملی.............................................................................. 27

1-4-2 روش های مختلف تعیین ساختار پروتئین ها.................................................................. 28

4-2-2 پیش بینی و طراحی ساختار پروتیئن................................................................................. 28

فصل سوم : سیستم های فازی...................................................................................................................... 30

1مقدمه........................................................................................................................................................ 31 -3

2-3 سیستم های فازی چگونه سیستم هایی هستند؟................................................................ 32

3-3 مجموعه فازی..................................................................................................................................... 33

1-3-3 تعریف مجموعه فازی................................................................................................................. 33

2-3-3 نمایش توابع تعلق....................................................................................................................... 33

4-3 عملیات روی مجموعه های فازی................................................................................................ 34

5 پایگاه قواعد و ساخت موتور استنتاج......................................................................................... 36 -3

1 تركیب ممدانی............................................................................................................................. 36 - 5-3

ط

فصل چهارم : پیاده سازی پیشگویی ساختار پروتئین ها با استفاده از كنترل فازی................. 37

1 مقدمه ...................................................................................................................................................... 38 -4

2-4 بدست آوردن ماكزیمم شباهت و پیشگویی ساختار پروتئین.......................................... 38

3-4 پیاده سازی روش ........................................................................................................................... 41

فصل ششم : نتیجه گیری وپیشنهادات........................................................................................................... 43

1نتیجه گیری..................................................................................................................................................... 44 -6

2پیشنهادات...................................................................................................................................................... 44 -6

منابع و ماخذ............................................................................................................................................................. 45

1 فهرست منابع فارسی......................................................................................................................................... 46

2 فهرست منابع لاتین........................................................................................................................................... 46

3 سایت های اطلاع رسانی.............................................................................................................................. 47

چكیده انگلیسی...................................................................................................................................................... 48